Natural de Dizangue, Camerún, comienza su carrera profesional con 21 años en el Canon Yaoundé. A partir de ahí su progresión fue como un cohete, en 1979 es nombrado mejor jugador Africano, siendo el primer guardameta en conseguirlo, pero no la primera, ya que en 1982 también fue galardonado con este premio. Tales eran sus características bajo palos, que pronto se hace con la titularidad en los "Leones Indomables" formando parte del combinado nacional que participo en el Mundial de España 82.
Tras el mundial el se le sitúa en España, más concretamente en el Racing de Santander, pero un problema a la hora de liberarlo para ir con su selección, hacen que N'Kono rompa el acuerdo y se marche R.C.D. Espanyol. Aquí comienza uno de los grandes idilios de la historia del futbol nacional. Permaneciendo ocho temporadas en el cuadro periquito, y siendo el segundo jugador extranjero con más partidos jugados con la camiseta blanquiazul.
El camerunés pronto se hizo valedor de todos los elogios que le llovían hacia su figura y llamaban la atención el uso de pantalón largo (debido a su sentido del pudor). Sus intervenciones eran prodigiosas ganándose la admiración de los rivales y convirtiéndose en el auténtico estandarte del Espanyol y de su afición. En su primera aparición en el Bernabeu fue despedido con una ovación tras el partido, al haber conseguido con sus intervenciones sacar un punto de Chamartín.
La temporada 87-88 es quizás la mejor de N'Kono con el Espanyol, la trayectoria irregular de liga contrastaba con el papel protagonista en la copa de la UEFA. Borussia de Monchegladbach, Milan, Inter de Milan, cayeron frente al todopoderoso N'Kono o mejor dicho “Il diavolo nero” apodado en Italia tras eliminar al los "rossoneri". Una lesión le impide jugar los cuartos de final y la ida de las semifinales frente al Brujas.
Los belgas partían con una ventaja de 2-0 y el cuadro de Javier Clemente consiguió darle la vuelta al marcador clasificándose para la final, evidentemente la figura de Thomas se hizo enorme manteniendo una vez más la portería a cero.
La final a doble partido se puso de cara con el 3-0 en Sarria y otra noche mágica de N'Kono, pero cuando todo parecía hecho, tras llegar al descanso 0-0 en Leverkusen, los alemanes consiguen empatar la eliminatoria y ganar el titulo en los penaltis.
En la temporada 88-89 el Espanyol desciende a segunda y pese a ello es convocado por los "Leones indomables" para el Mundial de Italia, donde hacen historia llegando a cuartos de final.
Al final de la temporada 89-90 pone fin a su periplo periquito, y ficha por el Sabadell donde mantiene un nivel excelente, pero que no consigue evitar el descenso a 2ª B. Pese a ello es convocado de nuevo con la selección para la cita mundialista en Estados Unidos donde no juega ni un minuto.
En enero de 1995 ficha por el Club Bolivar de Bolivia, donde está dos temporadas consiguiendo dos campeonatos de Liga, en 1997. Con 42 años decide retirarse del fútbol en activo. A partir de ahí forma parte del staff técnico de la Selección de Camerún como entrenador de porteros.
Actualmente es el entrenador de porteros del R.C.D. Espanyol siendo todo un referente para la afición periquita.
